Dne 29. julija 1999 sta začela veljati Sporazum med Vlado Republike Slovenije in Vlado Ruske federacije o mednarodnem cestnem prometu in Protokol o uporabi Sporazuma med Vlado Republike Slovenije in Vlado Ruske federacije o mednarodnem cestnem prometu, sklenjena 7. septembra 1998 (Uradni list RS – Mednarodne pogodbe, št. 14/99; v: Uradni list RS, št. 45/99).
Dne 10. avgusta 1999 je začel veljati Program sodelovanja v izobraževanju, znanosti in kulturi med Vlado Republike Slovenije in Vlado Slovaške republike za obdobje od 1999 do 2002, podpisan dne 9. februarja 1999 in objavljen v Uradnem listu Republike Slovenije – Mednarodne pogodbe, št. 19/99 (Uradni list RS, št. 58/99).
Dne 14. avgusta 1999 sta začela veljati Sporazum med Vlado Republike Slovenije in Vlado Republike Makedonije o sodelovanju na področju veterinarske medicine in Sporazum med Vlado Republike Slovenije in Vlado Republike Makedonije o sodelovanju na področju varstva rastlin, podpisana dne 16. decembra 1997 in objavljena v Uradnem listu Republike Slovenije – Mednarodne pogodbe, št. 16/99 (Uradni list RS, št. 53/99).
Dne 2. avgusta 1999 je začel veljati Sporazum med Vlado Republike Slovenije in Vlado Republike Latvije o sodelovanju v kulturi, izobraževanju in znanosti, podpisan dne 5. marca 1998 in objavljen v Uradnem listu Republike Slovenije – Mednarodne pogodbe, št. 10/99 (Uradni list RS, št. 28/99).
Dne 18. avgusta 1999 je začel veljati Okvirni sporazum med Republiko Slovenijo in Evropsko investicijsko banko o dejavnosti Evropske investicijske banke v Sloveniji, sklenjen dne 15. decembra 1997 in objavljen v Uradnem listu Republike Slovenije – Mednarodne pogodbe, št. 6/99 (Uradni list RS, št. 22/99).
Dne 1. septembra 1999 je začel veljati Sporazum med Republiko Slovenijo in Zvezno republiko Nemčijo o socialni varnosti, podpisan dne 24. septembra 1997 in objavljen v Uradnem listu Republike Slovenije – Mednarodne pogodbe, št. 12/99 (Uradni list RS, št. 34/99). Hkrati s sporazumom se je 1. septembra 1999 začel uporabljati tudi Dogovor o izvajanju Sporazuma z dne 24. septembra 1997 med Republiko Slovenijo in Zvezno republiko Nemčijo o socialni varnosti, podpisan in objavljen hkrati s sporazumom.
Od 15. oktobra 1996 sta v veljavi Sporazum o posojilu med Republiko Slovenijo in Mednarodno banko za obnovo in razvoj (Projekt za okolje – Geografski informacijski sistem) ter Sporazum o garanciji med Republiko Slovenijo in Mednarodno banko za obnovo in razvoj (Projekt za okolje – Program za zmanjševanje onesnaževanja zraka), oba podpisana v Washingtonu 18. junija 1996 in objavljena v Uradnem listu RS – Mednarodne pogodbe, št. 14/96 (Uradni list RS, št. 53/96).