Na podlagi prvega odstavka 41. člena zakona o urejanju naselij in drugih posegov v prostor (Uradni list SRS, št. 18/84, 37/85, 29/86 in Uradni list RS, št. 26/90, 18/93, 47/93, 71/93, 44/97) in 12. člena zakona o naravnem rezervatu Škocjanski zatok (Uradni list RS, št. 20/98) je Vlada Republike Slovenije sprejela

Z ureditvenim načrtom za naravni rezervat Škocjanski zatok (v nadaljnjem besedilu: ureditveni načrt) se, v skladu z določili zakona o naravnem rezervatu Škocjanski zatok (Uradni list RS, št. 20/98; v nadaljnjem besedilu: ZNRŠZ) in odloka o varstvu in razvoju naravnega rezervata Škocjanski zatok (Uradni list RS, št. 31/99), podrobneje določijo prostorski pogoji in prostorske ureditve, potrebne za ohranjanje in razvijanje naravnih vrednot območja naravnega rezervata.
Ureditveni načrt obsega območje, ki ga določa ZNRŠZ ter druga območja, potrebna za izvedbo ureditev, vezanih na naravni rezervat, ki bodo za takšen namen določene v prostorskih sestavinah planskih aktov Mestne občine Koper.

V postopku priprave ureditvenega načrta je treba izdelati vse potrebne posebne strokovne podlage v skladu z navodilom o vsebini posebnih strokovnih podlag in o vsebini prostorskih izvedbenih aktov (Uradni list SRS, št. 14/85) ter poročilo o vplivih na okolje v skladu z navodilom o metodologiji izdelave poročil o vplivih na okolje (Uradni list RS, št. 70/96).
Ureditveni načrt mora biti izdelan v skladu z zakonom o urejanju naselij in drugih posegov v prostor (Uradni list SRS, št. 18/84, 37/85, 29/86 in Uradni list RS, št. 26/90, 18/93, 47/93, 71/93, 44/97; v nadaljnjem besedilu: ZUN) in navodilom o vsebini posebnih strokovnih podlag in o vsebini prostorskih izvedbenih aktov.
Podroben seznam potrebnih strokovnih podlag ter natančno vsebino ureditvenega načrta se, ob upoštevanju določil ZUN ter navodila o vsebini posebnih strokovnih podlag in o vsebini prostorskih izvedbenih aktov, določi v podrobnejšem programu priprave ureditvenega načrta.

Postopek priprave ureditvenega načrta vodi Ministrstvo za okolje in prostor – Urad Republike Slovenije za prostorsko planiranje.
Direktor Urada Republike Slovenije za prostorsko planiranje na podlagi tega programa priprave določi podrobnejši program priprave ureditvenega načrta, v katerem določi zlasti:
– roke izdelave ureditvenega načrta,
– natančen seznam potrebnih posebnih strokovnih podlag,
– natančno vsebino ureditvenega načrta.
Naročnik ureditvenega načrta je Ministrstvo za okolje in prostor, Urad Republike Slovenije za prostorsko planiranje.
Investitor ureditve naravnega rezervata je Republika Slovenija, ki jo zastopa Ministrstvo za okolje in prostor – Agencija Republike Slovenije za okolje, Vojkova 1B, Ljubljana.

– Ministrstvo za informacijsko družbo, Uprava Republike Slovenije za telekomunikacije,
– Ministrstvo za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano,
– Ministrstvo za kulturo, Uprava Republike Slovenije za kulturno dediščino,
– Ministrstvo za obrambo, Inšpektorat Republike Slovenije za varstvo pred naravnimi in drugimi nesrečami,
– Ministrstvo za obrambo, Uprava za civilno obrambo,
– Ministrstvo za okolje in prostor, Agencija Republike Slovenije za okolje (področje varstva okolja in področje vodnega gospodarstva),
– Medobčinski zavod za varstvo naravne in kulturne dediščine Piran, enota za varstvo narave,
– Ministrstvo za promet,
– Ministrstvo za zdravje, Zdravstveni inšpektorat Republike Slovenije,
– Družba za avtoceste v Republiki Sloveniji,
– Zavod za gozdove Slovenije,
– Javni Zavod za ribištvo Slovenije,
– Elektro Slovenija, d.o.o., javno podjetje za prenos električne energije,
– Elektro Primorska Nova Gorica, d.d., Poslovna enota Koper,
– Telekom Slovenije, d.d.,
– Mestna občina Koper in njene javne gospodarske službe v delih, kjer so upravljavci komunalne in druge infrastrukture.
Ta program se objavi v Uradnem listu Republike Slovenije.